อย. ได้จัดทำ “คู่มือแนวทางการตรวจประเมินตามหลักเกณฑ์วิธีการที่ดีในการกระจายยา” (GDP) ที่มีเนื้อหาเป็นไปตามแนวทางของ PIC/S และสอดคล้องกับสถานการณ์ของประเทศ เพื่อให้พนักงานเจ้าหน้าที่ใช้ เป็นแนวทางในการตรวจประเมินผู้ประกอบการ

โดย GDP จะมีองค์ประกอบทั้งหมด 9 หมวด ได้แก่
หมวด 1 : การบริหารจัดการคุณภาพ
หมวด 2 : บุคลากร
หมวด 3 : อาคารสถานที่ และอุปกรณ์
หมวด 4 : ระบบเอกสาร
หมวด 5 : การดำเนินการ
หมวด 6 : ข้อร้องเรียน การคืนผลิตภัณฑ์ยา ยาปลอม และการเรียกคืนผลิตภัณฑ์ยา
หมวด 7 : การจ้างหน่วยงานภายนอก
หมวด 8 : การตรวจสอบตัวเอง
หมวด 9 : การขนส่ง